Krajowa Informacja Skarbowa (KIS) w swojej interpretacji wyjaśniła, że podatnicy, którzy nabywają usługi inwestycyjne związane zarówno z czynnościami opodatkowanymi, jak i zwolnionymi od podatku VAT, a nie mogą jednoznacznie przypisać wydatków do konkretnego rodzaju sprzedaży, mają prawo do obniżenia podatku należnego w części odpowiadającej proporcji określonej w art. 90 ust. 2 ustawy o podatku VAT. Proporcję tę można ustalić na podstawie metody wskazanej w art. 90 ust. 3 tej ustawy.
Rozliczenie podatku VAT w kontekście usług inwestycyjnych
Podatnik jest przedsiębiorcą prowadzącym działalność gospodarczą w Polsce, podlegającym nieograniczonemu obowiązkowi podatkowemu. Jego działalność obejmuje między innymi realizację projektów budowlanych związanych z budową budynków mieszkalnych i niemieszkalnych. Obecnie podatnik rozpoczyna projekt inwestycyjny polegający na budowie budynku mieszkalnego wielorodzinnego z lokalami użytkowymi na parterze oraz piwnicami i garażami podziemnymi. Całkowita powierzchnia użytkowa budynku wynosi 2 652,46 m2, a udział powierzchni niemieszkalnych w całkowitej powierzchni wynosi 31,17%. Podatnik uważa, że podatek naliczony związany z lokalem mieszkalnym nie podlega odliczeniu, ponieważ lokale te są objęte zwolnieniem od podatku VAT. Jednakże podatek naliczony z usług związanych z lokalami użytkowymi i garażami podlega odliczeniu w pełnej wysokości.
Stanowisko KIS
KIS nie zgodziła się ze stanowiskiem podatnika, wyjaśniając, że w przypadku zakupu usług inwestycyjnych nie można jednoznacznie przypisać do konkretnego rodzaju sprzedaży (opodatkowanej lub zwolnionej od podatku VAT). Podatnicy, którzy nabywają usługi inwestycyjne związane zarówno z czynnościami opodatkowanymi, jak i zwolnionymi od podatku VAT, mogą proporcjonalnie rozliczyć podatek naliczony. Proporcja ta powinna być ustalona zgodnie z art. 90 ust. 2 ustawy o podatku VAT. Proporcję tę można ustalić na podstawie metody wskazanej w art. 90 ust. 3 tej ustawy.
Stanowisko organu podatkowego oznacza, że przedsiębiorcy nie mogą wyłączyć całkowicie podatku naliczonego związanego z usługami inwestycyjnymi, które są związane zarówno z czynnościami opodatkowanymi, jak i zwolnionymi od podatku VAT. W praktyce oznacza to, że podatnik musi skorzystać z metody proporcjonalnego rozliczenia podatku naliczonego, aby dokładnie określić kwotę podatku odliczonego.